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MALDI-TOF AUTOF MS 1000

Autof女士1000

微生物学的革命

微生物鉴定在物种层次上是原则客观的微生物学1.. 多年来,这样一项壮举是通过艰苦的生化分析完成的。虽然核酸测序技术的进步使微生物的高特异性检测率成为可能,但这些技术也同样重要费时的花钱多的平淡无奇2.

Hardy Diagnostics自豪地介绍

Autof ms 1000*

这个Autof女士1000提供自动化,高速高度自信识别和分类学激光诱导分类基于蛋白质组指纹图谱的细菌、酵母、真菌和丝状真菌的研究。大量研究已经证明了这一点更高的准确性,更快的结果时间,低成本MALDI-TOF技术与传统方法的比较3,4,5.

特征:

  • 与传统方法和PCR相比,结果更快6.
  • 与核酸测序技术类似的准确性7.
  • 有成本效率的8.
  • 健壮,直观的软件,支持21 CFR第11部分
  • 安装鉴定/运行鉴定性能验证支持
  • LIMS/LIS连接和支持
  • 大约有5,000种的数据库,超过15,000个菌株
  • 可在不到20分钟的实际操作时间内识别96个样本

*制造AUTOF MS 1000
由Autobio Diagnostics Co.LTD.为Hardy Diagnostics提供

*仅供研究使用。不用于临床诊断程序。

概述

MALDI-TOF原理

质谱是一种分析技术,其离子促进从溶液到气体分子的相转变,以遵循瞬态电荷。测量分子的质量(m)(z)比率(m / z),可以确定分子量1,2.质谱法在化合物上的应用是有限的,但MALDI-TOF技术的出现增加了对大分子(如蛋白质)分析的适用性的广度2..MALDI(辅助激光解吸/电离)技术是一种“软离子化”的方法,最小化分子破碎程度并保持样品完整性。蛋白质组学研究中的应用已经为Maldi-Tof的Zenith铺平了道路:微生物鉴定。

通过与基质(CHCA - α-氰基-4-羟基氨基酸)的溶液混合来制备微生物样品,一种能够吸收紫外线的有机化合物(n2.激光,λ = 337 nm),并将紫外光转换为热能,并引入高真空环境。当基体和样品一起加入并干燥后,混合物结晶,将样品包封在同一层状晶体中。激光照射混合物导致基质快速加热,并随着微生物蛋白质转变为气态。通过与基质的质子转移,气态多肽转化为离子,带电粒子2..质子化离子通过电场加速,并通过电压电位分离(V.0)基于每个离子的质量电荷比(m/z)的差异。离子通过飞行管的加速发生在高真空环境中,以确保离子自由飞行至质量分析仪(检测器)。然后可通过MALDI-TOF ms检测离子,以确定其各自的分子量(Da)。

参考

1. Olshina,M. A.,&Sharon,M.(2016)。质谱:多面分析技术。生物物理季刊,49,e18。https://doi.org/10.1017/S0033583516000160

2. Singhal,N.,Kumar,M.,Kanaujia,P. K.,&Virdi,J. S.(2015)。MALDI-TOF质谱:微生物鉴定和诊断的新兴技术。微生物学前沿,6., 791.https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00791

数据库

Autof ms 1000具有以下功能:最广泛的数据库E在行业中。
用超过15000株,每个都有超过5参考光谱,平均超过每种物种10株,
Autof MS 1000的数据库提供高度准确的结果

本地数据库共包括1003年属,4,943种物种,15,993株

克+

公克 -

酵母

Filmamentousous_fungi-crop.

丝状真菌

分枝杆菌作物

分枝杆菌

作为伙伴关系的一部分,哈代诊断和AutoBio Diagnostics Co. Ltd。不断增强autof ms 1000数据库.不断添加新的菌株和物种,改善可靠性精确这是系统的一部分。

这个Autof女士1000数据库包含来自以下问题的多种参考株

世界上不同的地理区域

不同标本

不同的文化媒体类型

不同的生长条件

在物种中捕获自然系统发育多样性的标准

工作流

自动的ms 1000工作流需要最少的实际操作时间

单一工作流

Autof ms 1000工作流设计高效、简单,适用于任何分离物,无论是细菌、酵母还是霉菌。制备每个分离物所需的最少动手时间允许在20分钟内制备、采集和分析总共96个细胞样本靶板。

    • 独特的快速识别功能可在0.1秒内显示单个样本的测试结果
    • 96个样本的平均识别(采集和数据分析)时间为17.5分钟
    • 批处理功能可以完全可自定义的格式编辑和识别示例
    • 访问LIMS/LIS系统。报告自动发布

没有质谱分析的经验要求!

直观的软件

易于使用的软件提供友好的用户体验。Autof Reticirer旨在遵守受管制的工作环境的严格和标准。

    • 验证
    • 用户管理
    • 数据存档
    • 审计跟踪,包括时间戳

Autof获取者自动从频谱采集中自动化整个过程以报告生成。报告包括示例位置,名称,描述和置信度分数的摘要。

结果以易于读取的颜色编码方案呈现,这使得简单的解释。

AUTOF MS 1000结果可以以LIM可以轻松读取的格式导出。

数据可以下载为EXCEL、TXT或其他文件格式,以便进一步分析。

需要创建本地数据库的实验室可以在配套软件应用程序中创建本地数据库。

技术规格

目标幻灯片样本
96电池不锈钢靶滑动可重复使用的磁架

样品在/
全自动样品介绍机制
目标滑动平台是一个由步进线性执行器控制的X-Y工作台
步进直线驱动器每步5 μm (10 μm重复性),用于精确的目标滑动定位

离子源
Matrix-Assisted激光解吸/电离
无清洁离子源
延迟提取技术:0~1000ns
可变离子源电压:0~+20kV

探测器
典型的乘数增益106 at 2800kv
单离子事件的脉冲宽度(FWHM):<2.35 ns
线性操作的峰值电流输出:10 mA

真空
机械泵和涡轮分子泵可建立高达10-7 mbar的真空

大众分辨率
1)单蛋白质

血管紧张素原:m/z=1760.01(m+H)+,质量分辨率≥3600
细胞色素C:M / Z = 12362.96(M + H)+,质量分辨率≥800

2)混合蛋白质
胰岛素:m/z=5808.57(m+H)+,质量分辨率≥400
肌红蛋白M2+:m/z=8477.14(m+2H)2+,质量分辨率≥600
细胞色素C:M / Z = 12362.96(M + H)+,质量分辨率≥700

方面
高度:1250mm
深度:705mm
宽度:450mm.
重量:101kg.

样本观察系统
单色CCD相机提供样品的实时视频输入
从软件界面在样本查看区域显示进尺

激光
337纳米氮激光器,固定聚焦,4亿次(10年平均寿命)
脉冲宽度:2.5 ns
频率:1-60赫兹,可调

质量分析仪
直线飞行管:1050毫米

滤器
0.01μm高精度过滤器–99.99%的病原微生物在加工后过滤

性能数据

常见问题

MALDI-TOF MS应用的局限性是什么?

由于某些微生物物种与某些微生物复合物之间的紧密遗传关系,当使用MALDI TOF质谱时,鉴定结果可能易于误差1.. 在这种情况下,需要额外的验证性分析。Autof ms 1000设计用于在需要额外确认措施时提醒最终用户。

下表是使用MALDI-TOF质谱技术时一些容易出错的物种/复合物的说明。

MALDI-TOF ms能检测病毒吗?

MALDI-TOF质谱法检测病毒的过程比细菌和真菌复杂13.目前主要有两种方法:(1)蛋白质检测,即直接从细胞培养的质谱中鉴定病毒粒子的特征蛋白(Autof ms 1000目前没有这样的数据库;用户必须自己构建);(2)核酸分子检测:该方法主要基于多重PCR和质谱联用。其原理是先用PCR方法对病毒核酸物质进行富集,然后为待检测病毒添加特异性引物,再通过序列特异性引物实现单碱基延伸,获得产物片段,脱盐后进行质谱检测。该方法可用于呼吸道病毒、流感病毒、肠道病毒、人乳头瘤病毒等的检测,具有通量高、成本低、灵敏度高的优点14

Autof ms 1000的质量控制流程是什么?

注意:在执行质量控制之前,请校准AUTOF MS 1000。质量控制应每周进行一次。应打印和存档质量控制报告的结果。

与其他微生物检测方法相比,MALDI TOF ms技术的优缺点是什么?

表参考14

参考

1. Rychert,J.(2019年7月02日)。MALDI-TOF质谱法鉴定微生物的益处和局限性. 于2021年3月25日检索自https://www.infectioologyjournal.com/articles/benefits-and-limitations-of-malditof-mass-pectromicry-for-the-idtified-of-microorganisms.html.

2.。Paauw, A., Jonker, D., Roeselers, G., Heng, J. M., Mars-Groenendijk, R. H., Trip, H., Molhoek, E. M., Jansen, H. J., van der Plas, J., de Jong, A. L., Majchrzykiewicz-Koehorst, J. A., & Speksnijder, A. G. (2015).MALDI-TOF质谱法快速、可靠地鉴别志贺氏菌和大肠杆菌国际医学微生物学杂志:IJMM,305(4-5),446-452。https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2015.04.001

3.黄,K.,达利瓦尔,S.,比劳卡,J.,斯利格利,J.A.,香槟,S.,罗姆尼,M.G.,蒂利,P.,萨达兰加尼,M.,兹洛斯尼克,J.,和齐尔弗斯,M.A.(2020年)。矩阵辅助激光解吸/电离飞行时间MS,用于准确识别洋葱伯克霍尔德菌复杂和Burkholderia Gladioli在临床微生物实乐动体育彩票验室。医学微生物学杂志,69.(8),1105-1113。https://doi.org/10.1099/jmm.0.001223

4. Garrigos,T.,Neuwirth,C.,Chapuis,A.,Bador,J.,Amoureux,L.和合作者(2021)。基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速准确常规鉴定无色杆菌物种数据库的开发乐动体育彩票临床微生物学和感染:欧洲临床微生物学和传染病学会的官方出版物,27(1) ,126.e1-126.e5。https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.03.031

5.(2018)。MALDI-TOF MS的脑膜炎脑脑奈丁鉴定可能不可靠乐动体育彩票临床微生物学和感染:欧洲临床微生物学和传染病学会的官方出版物,25(6),717-722。https://doi.org/10.1016/j.cmi.2018.09.015

6.Shell, W. S., Sayed, m.l., Allah, F., Gamal, F., Khedr, A. A., Samy, A. A., & Ali, A.(2017)。基质辅助激光解吸 - 电离 - 飞行时间质谱法作为可靠的蛋白质组学方法来表征大肠杆菌沙门氏菌隔离。兽医世界,10(9), 1083–1093.https://doi.org/10.14202/vetworld.2017.1083-1093

7. Pavlovic,M.,Konrad,R.,Iwobi,A. N.,Sing,A.,Busch,U.,Huber,I.(2012)。采用MALDI-TOF MS和实时PCR的双重方法快速鉴定阴沟肠杆菌复合体中的菌种有限元微生物学,328(1) 46-53。https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2011.02479.x

8.卡格,A.,斯托克,R.,齐勒,M。快速鉴定Burkholderia Mallei类鼻疽伯克霍尔德菌完整的细胞基质辅助激光解吸/电离质量光谱键入微晶体12,229 (2012).https://doi.org/10.1186/1471-2180-12-229

9莱切特,J.(2019年,2002年7月)。MALDI-TOF质谱法鉴定微生物的益处和局限性. 于2021年3月25日检索自https://www.infectioologyjournal.com/articles/benefits-and-limitations-of-malditof-mass-pectromicry-for-the-idtified-of-microorganisms.html.

10Jeong,S.,Hong,J.S.,Kim,J.O.,Kim,K.H.,Lee,W.,Bae,I.K.,Lee,K.,和Jeong,S.H.(2016)。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法鉴定不动杆菌。历史实验室医学,36(4), 325–334.https://doi.org/10.3343/alm.2016.36.4.325

11.Vavrova、。巴拉ž卵子,T, Sedlaček,我,Tvrzova, L, &Š江户,o .(2015)。MALDI-TOF质谱分析用于鉴定新描述的气单胞菌spp。folia microbiologica.,60.(5), 375–383.https://doi.org/10.1007/s12223-014-0369-4

12德拉普,N.,李,C.,奥康纳,J.,和科米坎,M.(2014)。Vitek 2系统李斯特里亚单核细胞增生的误诊。临床微生物学杂志乐动体育彩票,52.(9), 3494–3495.https://doi.org/10.1128/JCM.01725-14

13.Majchrzykiewicz-Koehorst, J. A., Heikens, E., Trip, H., Hulst, A. G., de Jong, A. L., Viveen, M. C., Sedee, N. J., van der Plas, J., Coenjaerts, F. E., & Paauw, A. (2015).用质谱法快速和通用地鉴定甲型流感和其他呼吸道病毒。病毒学方法杂志,21375-83。https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2014.11.014

14辛哈尔,N.,库马尔,M.,卡诺加,P.K.,和维迪,J.S.(2015)。MALDI-TOF质谱:微生物鉴定和诊断的新兴技术。微生物学前沿,6., 791.https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00791

15Buchan,B.W.,和Ledeboer,N.A.(2014)。临床微生物实验室的新兴技术。乐动体育彩票乐动体育彩票临床微生物学评价,27(4), 783 - 822。https://doi.org/10.1128/CMR.00003-14

16莱切特,J.(2019年,2002年7月)。MALDI-TOF质谱法鉴定微生物的益处和局限性. 于2021年3月25日检索自https://www.infectioologyjournal.com/articles/benefits-and-limitations-of-malditof-mass-pectromicry-for-the-idtified-of-microorganisms.html.

17.刘,H.,Du,Z.,Wang,J.,&Yang,R.(2007)。用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法表征细菌的通用样品制备方法。应用与环境微生物学,73.(6), 1899 - 1907。https://doi.org/10.1128/AEM.02391-06

18辛哈尔,N.,库马尔,M.,卡诺加,P.K.,和维迪,J.S.(2015)。MALDI-TOF质谱:微生物鉴定和诊断的新兴技术。微生物学前沿,6., 791.https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00791


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参考

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2.邓,J.,傅,L.,王,R.,余,N.,丁,X.,江,L.,方,Y.,江,C.,林,L.,王,Y.,车,X.(2014)。MALDI-TOF MS、基因测序和Vitek 2在73株肠道病原体临床分离株鉴定中的比较胸部疾病杂志,6.(5),539-544。https://doi.org/10.3978/j.issn.2072-1439.2014.02.20

3.Florio, W., Tavanti, A., Barnini, S., Ghelardi, E., & Lupetti, A.(2018)。MALDI-TOF质谱诊断微生物感染的最新进展和面临的挑战微生物学前沿,9, 1097.https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01097

4.徐,S.,周,C.,张,P.,冯,C.,张,T.,Sun,Z.,Zhuang,H.,Chen,H.,Chang,Q.,Jiang,R。,李,H.,&Ni,Y。(2020)。MALDI-TOF MS与常规微生物培养对疑似眼内炎患者的诊断性能比较眼免疫学与炎症,28(3), 483–490.https://doi.org/10.1080/09273948.2019.1583346

5. Patel,T.S.,Kaakeh,R.,Nagel,J.L.,Newton,D.W.W.,​​J.G。(2016)。实施基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱加实时抗菌药物管理干预治疗血流感染的成本分析。临床微生物学杂志乐动体育彩票,55.(1), 60–67.https://doi.org/10.1128/jcm.01452-16

6.徐,年代,周、C。张,P,冯,C。,,T,太阳,Z,壮族,H,陈,H, Chang问,江,R,李,H, &倪y(2020)。与传统微生物培养相比,MALDI-TOF MS在疑似眼内炎患者中的诊断性能。眼免疫学与炎症,28(3), 483–490.https://doi.org/10.1080/09273948.2019.1583346

7.Florio, W., Tavanti, A., Barnini, S., Ghelardi, E., & Lupetti, A.(2018)。MALDI-TOF质谱诊断微生物感染的最新进展和面临的挑战微生物学前沿,9, 1097.https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01097

8. Patel,T.S.,Kaakeh,R.,Nagel,J.L.,Newton,D. W. W.,史蒂文森,J.G。(2016)。实施基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱加实时抗菌药物管理干预治疗血流感染的成本分析。临床微生物学杂志乐动体育彩票,55.(1), 60–67.https://doi.org/10.1128/jcm.01452-16

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